Fondamenti di Biologia Algoritmica e Genomica Computazionale

La biologia computazionale si basa su algoritmi efficienti per decifrare dati genomici complessi e risolvere le moderne sfide biologiche. Questo corso basato su testo ti guida attraverso i concetti fondamentali, la terminologia e i principi algoritmici essenziali per l'analisi di sequenze e strutture biologiche. Esplorerai l'intersezione tra informatica e biologia, imparando come i paradigmi algoritmici fondamentali affrontano problemi genomici reali. Il materiale di lettura inizia con chiare definizioni della terminologia chiave prima di passare a strategie pratiche di risoluzione dei problemi e modelli computazionali. Cosa imparerai: - Comprendere la terminologia biologica fondamentale e le strutture dati utilizzate nella bioinformatica - Applicare tecniche di programmazione dinamica per l'allineamento di sequenze a coppie e multiplo - Esplorare gli algoritmi sui grafi utilizzati nell'assemblaggio del genoma de novo e nella ricostruzione di frammenti - Analizzare gli algoritmi per la costruzione di alberi filogenetici e la modellazione evolutiva - Esaminare i moderni approcci computazionali ai dati di sequenziamento ad alta resa - Esercitarsi a formulare problemi biologici come problemi algoritmici strutturati Il corso inizia con le definizioni biologiche fondamentali e le basi della manipolazione delle stringhe, prosegue attraverso gli algoritmi standard di allineamento e assemblaggio, e si conclude con un'analisi dei problemi computazionali aperti nella genomica moderna. Questo corso è progettato per principianti interessati alla bioinformatica, studenti di informatica e studenti autodidatti che cercano una chiara introduzione scritta alla biologia algoritmica, senza alcuna esperienza pregressa di genomica computazionale richiesta. Inizia a leggere per costruire una solida base negli algoritmi che stanno plasmando la moderna ricerca biologica.