การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของแบคทีเรีย: ชีวสารสนเทศและเครื่องมือสำหรับผู้เริ่มต้น

เนื่องจากการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของแบคทีเรีย (WGS) เข้ามาแทนที่วิธีการทางห้องปฏิบัติการแบบดั้งเดิมอย่างรวดเร็วทั้งในงานวิจัยและการแพทย์ การทำความเข้าใจวิธีการประมวลผลและตีความข้อมูลจีโนมจึงกลายเป็นทักษะที่จำเป็น หลักสูตรนี้เชื่อมโยงช่องว่างระหว่างจุลชีววิทยาและชีวสารสนเทศ โดยจะนำคุณผ่านกระบวนการดิจิทัลที่ใช้ในการวิเคราะห์เชื้อโรคแบคทีเรีย คุณจะได้เปลี่ยนจากการทำความเข้าใจข้อมูลการจัดลำดับดิบไปสู่การดึงข้อมูลเชิงลึกทางชีววิทยาที่นำไปใช้ได้จริง เมื่อสิ้นสุดหลักสูตรนี้ คุณจะเข้าใจขั้นตอนการทำงานของ WGS ทั้งหมด และรู้สึกมั่นใจในการใช้งานเครื่องมือดิจิทัลที่ใช้ในการระบุแบคทีเรีย ตรวจหายีนดื้อยา และสอบสวนการระบาด สิ่งที่คุณจะได้เรียนรู้: - ทำความเข้าใจหลักการพื้นฐานของโครงสร้างจีโนมแบคทีเรียและเทคโนโลยีการจัดลำดับสมัยใหม่ - ดำเนินการควบคุมคุณภาพและการประมวลผลเบื้องต้นสำหรับข้อมูลการจัดลำดับดิบโดยใช้เครื่องมือชีวสารสนเทศสมัยใหม่ - เรียนรู้แนวคิดของการประกอบจีโนม (genome assembly) และวิธีการประเมินคุณภาพของการประกอบ - ระบุยีนดื้อยาต้านจุลชีพ (AMR) และปัจจัยก่อโรค (virulence factors) จากลำดับจีโนม - ใช้ฐานข้อมูลจีโนมสาธารณะและเครื่องมือบนเว็บเพื่อเปรียบเทียบสายพันธุ์แบคทีเรียและติดตามความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ หลักสูตรเริ่มต้นด้วยคำศัพท์พื้นฐาน เคมีของการจัดลำดับ และรูปแบบข้อมูล ก่อนที่จะก้าวไปทีละขั้นตอนผ่านการควบคุมคุณภาพ การประกอบจีโนม การทำคำอธิบายประกอบ และการประยุกต์ใช้ทางระบาดวิทยาในทางปฏิบัติ คำอธิบายที่เป็นลายลักษณ์อักษรและการสาธิตเชิงปฏิบัติจะช่วยให้คุณสร้างรากฐานทางแนวคิดและการปฏิบัติที่แข็งแกร่ง หลักสูตรนี้ออกแบบมาสำหรับผู้เริ่มต้น รวมถึงนักจุลชีววิทยา ผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์ เจ้าหน้าที่สาธารณสุข และนักศึกษาที่ไม่มีพื้นฐานด้านชีวสารสนเทศหรือการเขียนโปรแกรมมาก่อน เริ่มต้นการเดินทางสู่จีโนมิกส์ของแบคทีเรียและปลดล็อกพลังของข้อมูลลำดับได้แล้ววันนี้