16S Metabarcoding und Metagenomics Analyse mit Galaxy

Das Verständnis der komplexen Welt der mikrobiellen Gemeinschaften ist für die moderne biologische und medizinische Forschung unerlässlich. Rohsequenzdaten können jedoch überwältigend sein. In diesem textbasierten Kurs lernen Sie, wie Sie 16S-rRNA-Daten mit Galaxy verarbeiten und interpretieren. Am Ende dieses Kurses werden Sie vom Anfänger zum selbstbewussten Analysten, der in der Lage ist, Standard-Metagenomics-Pipelines auszuführen.Sie werden klare Erklärungen lesen, die zugrunde liegenden biologischen Konzepte verstehen und lernen, taxonomische Profile zu interpretieren. Was Sie lernen: Grundlegende Konzepte der 16S-rRNA-Sequenzierung, Metabarcoding und Metagenomik verstehen; Navigieren Sie durch die Galaxy-Plattformoberfläche, um Daten hochzuladen, Tools auszuführen und den Verlauf zu verwalten; Führen Sie Qualitätskontrolle und Vorverarbeitung von Rohsequenzdaten durch, um zuverlässige Ergebnisse zu gewährleisten; Klassifizieren Sie taxonomische Gruppen und vergleichen Sie Operational Der Kurs beginnt mit der Kernterminologie und der Theorie hinter der Marker-Gen-Sequenzierung, bevor Sie Schritt für Schritt durch eine vollständige Datenanalyse-Pipeline geführt werden.Diese Kurse werden in einem 10-tägigen Zeitraum von 16-20 Stunden pro Woche durchgeführt. Sie lernen, Tools zu konfigurieren, Aufgaben miteinander zu verknüpfen und häufige Probleme mit der Datenqualität zu beheben. Dieser Kurs richtet sich an Anfänger, Studenten und Forscher in den Lebenswissenschaften, die Mikrobiomdaten analysieren möchten, ohne Kommandozeilencode zu schreiben. Beginnen Sie Ihre Reise in die mikrobielle Datenanalyse und enthüllen Sie noch heute die Geheimnisse des Mikrobioms.