Introduction à la bioinformatique : Assemblage et identification des génomes viraux

Lorsqu'un nouveau virus émerge, la première étape pour le combattre est de décoder son plan génétique. La bioinformatique fournit les outils computationnels essentiels pour transformer les données brutes de séquençage en un génome viral complet et identifiable. Dans ce cours textuel, vous apprendrez les concepts fondamentaux de la biologie computationnelle et suivrez le processus étape par étape utilisé pour assembler et identifier les agents pathogènes viraux, tels que le SARS-CoV-2. Vous comprendrez comment les scientifiques décodent les séquences génétiques, effectuent le contrôle qualité des données génomiques et utilisent des algorithmes d'alignement pour reconstruire le code génétique d'un virus. Ce que vous apprendrez : - Comprendre les principes fondamentaux de la génomique, du séquençage de l'ADN et de la réplication virale. - Apprendre à analyser les formats de données génomiques tels que FASTA et FASTQ. - Appliquer des algorithmes d'alignement de séquences et d'assemblage de génomes pour reconstruire les génomes viraux. - Explorer les bases de données biologiques publiques pour récupérer et comparer des données de séquences de référence. - Identifier les mutations génétiques et les variations dans les génomes des agents pathogènes à l'aide d'outils computationnels. - S'entraîner à écrire des scripts Python de base pour automatiser l'analyse des séquences d'ADN. Ce guide écrit commence par la terminologie génomique fondamentale avant de passer à la manipulation pratique des données, à l'alignement des séquences et à l'analyse comparative. Vous lirez des explications claires et étudierez des exemples de code qui démontrent comment les données biologiques brutes deviennent des informations scientifiques exploitables. Ce cours est conçu pour les débutants intéressés par la biologie computationnelle, la biotechnologie ou la programmation. Aucune connaissance préalable en bioinformatique ou en biologie avancée n'est requise. Commencez votre voyage dans la biologie computationnelle et apprenez à décoder les génomes des agents pathogènes viraux dès aujourd'hui.