Programmazione per l'Assemblaggio del Genoma e Fondamenti di Bioinformatica

La biologia moderna genera enormi quantità di dati che richiedono strumenti computazionali sofisticati per essere interpretati. Questo corso ti introduce al mondo della bioinformatica concentrandosi sull'assemblaggio del genoma—il processo di unire milioni di frammenti di DNA in un'unica sequenza. Passerai dalla comprensione delle basi biologiche all'implementazione degli algoritmi che aiutano gli scienziati a identificare patogeni sconosciuti e a studiare il codice genetico. Leggendo spiegazioni dettagliate e applicando la logica a scenari di programmazione, costruirai una solida base su come il software guida la scoperta biologica. Cosa imparerai: * Comprendere i principi biologici e computazionali fondamentali dell'assemblaggio del genoma * Applicare concetti di teoria dei grafi come i percorsi di De Bruijn alla ricostruzione di sequenze * Praticare l'analisi dei k-mer per gestire in modo efficiente i dati genetici frammentati * Implementare algoritmi fondamentali di overlap-layout-consensus per la mappatura del DNA * Apprendere moderni modelli di programmazione per la bioinformatica, incluse strutture dati type-safe * Analizzare la logica alla base della risoluzione di misteri di focolai batterici reali tramite codice Il corso inizia con la terminologia essenziale e la storia del sequenziamento prima di passare alle sfide algoritmiche utilizzate dai ricercatori moderni. Questo programma basato su testo è progettato per principianti con un interesse di base nella programmazione e nella biologia; non è richiesta alcuna esperienza precedente in bioinformatica. Inizia oggi il tuo viaggio nell'intersezione tra codice e scienze della vita.